1、北京三元食品股份有限公司的三元架構
1、低溫事業部
主要負責低溫產品在北京、天津、河北北部、內蒙古、黑龍江、吉林、遼寧、江西、廣西、廣東、福建、海南等地的三元低溫產品的生產和銷售。
2、常溫事業部
主要負責常溫產品在北京、天津、河北北部、內蒙古、黑龍江、吉林、遼寧、江西、廣西、廣東、福建、海南等地的三元低溫產品的生產和銷售。
3、送奶到戶事業部
主要負責三元產品的送奶到戶業務生產及銷售。
4、乾酪奶粉事業部
主要負責三元大包奶粉、乳清、煉乳、乾酪產品的生產及銷售。
5、華東事業部
2010年4月，經首都農業集團、北京三元食品股份有限公司董事會批准，為實現產銷協調一體化運行，加快三元產品華東、山東市場的營銷工作全面推進，發揮資源集約共享的優勢，成立 北京三元食品股份有限公司華東事業部，以市場為導向實行事業部制，統轄上海三元乳業有限公司、山東三元乳業有限公司、江蘇三元雙寶乳業有限公司。
華東事業部生產、營銷的液奶產品共有三元品牌的滅菌磚、滅菌枕、百利包3大系列37個品種。公司員工總數已經近700人。
北京三元食品股份有限公司華東事業部將續寫三元品牌半個多世紀輝煌歷史，創新發展，兢兢業業打造首都品質，放心三元的產品理念， 為華東地區、山東省的消費者奉獻來自首都的、人民大會堂宴會使用的健康、放心的牛奶。 三元牛奶2008年全系列經受住了考驗，沒有檢測出來「三聚氰胺」，可控的奶源，帶來放心的品質，謹慎負責的作風，造就一流品質的「放心奶」。
主要負責山東、上海、江蘇、浙江等地區三元產品的生產及銷售。 1、澳大利亞三元經貿有限公司
是北京三元食品股份有限公司在澳大利亞獨資設立的境外企業。澳洲三元注冊資本587.03萬澳元，經營范圍：從事澳大利亞乳製品及食品添加輔料等的貿易。澳洲三元充分利用澳大利亞的乳業優勢，在澳大利亞采購優質低價原料，為北京三元食品股份有限公司的快速發展奠定了堅實的基礎。
2、河北三元食品有限公司
河北三元食品有限公司於2008年12月10日登記注冊，是一家集畜牧科技研究、新產品開發、乳與乳製品 加工、銷售於一體的大型乳品企業，系北京三元食品股份有限公司的全資子公司，隸屬於擁有總資產150億元的北京首都農業集團（原北京三元集團）。公司現有4家乳品加工廠、1家包裝廠、1家奶牛養殖場。公司液奶產品共有滅菌磚、滅菌枕、百利 包3大系列37個品種；豆粉、豆奶粉、成人配方奶粉、嬰幼兒配方奶粉共計3大品類5大系列23個品種已上市。液奶主銷3個省區市場，奶粉主銷13個省區市場。公司員工總數近2500人。
河北三元食品有限公司負責河北南部、河南、山西、安徽、湖南、湖北、陝西、重慶、四川、雲南、貴州、寧夏、青海、甘肅、新疆、西藏等地三元液態奶的生產銷售及全國小包裝奶粉的生產和銷售。 1、呼倫貝爾三元乳業有限責任公司
呼倫貝爾三元乳業有限責任公司，是2000年3月成立的由北京三元食品股份有限責任公司控股的中外合資企業。公司日加工 鮮奶能力300噸，現有員工372名。主要產品有「三元」牌奶粉、奶油、液態奶、精製乳糖、乾酪素等五個系列十幾個品種，其中全脂奶粉、脫脂奶粉、全脂甜 奶粉、奶油是中國綠色食品發展中心認定的「綠色食品」。是呼倫貝爾市最大的乳製品綜合加工企業，是中國農學會確定的「綠色奶業示範基地」。
公司經營范圍主要包括牛奶收購、加工、銷售乳製品相關的產品（國家法律、法規規定應經審批的，未獲審批前不得生產經營。公司主營業務為牛奶收購、乳製品加工及銷售。
呼倫貝爾三元乳品公司生產線
2、北京三元梅園乳品發展有限公司
梅園乳品店創立於上世紀八十年代， 以經營宮廷奶品為特色。
從第一家梅園台基廠店開業，到今天已發展到擁有三十家分店的大型三元梅園乳品發展有限公司。
宮廷奶品乃宮廷御膳之珍品，後傳入了民間，有詩雲：「奶茶有鋪獨京華，乳酪如冰浸齒牙」。贊譽了宮廷奶品的做工精緻、口感細膩、鮮新美味和不可多得。為了 使這一美味珍饈源 遠流長，北京市牛奶公司當年聘請末代皇帝的胞弟溥傑先生、相聲藝術大師侯寶林先生為名譽顧問。聘請御膳房傳人指導、挖掘、整理了十幾種宮廷秘方，將這特有古老的傳統美食與現代企業文化相結合，帶給人們全新的飲食觀念。梅園的宮廷奶品曾二次東渡日本參加世界食品博覽會受到世界各國的贊譽。
為將這一中華民族特有的奶品文化發揚光大，2004年8月，由北京三元食品股份有限公司和北京市牛奶公司共同出資1000萬元， 成立了北京三元梅園乳品發展有限公司。
3、遷安三元食品有限公司
系經唐山市商務局以唐商外資字（2004）150號文批准成立的有限責任公司，由河北省人民政府於2004年11月3日頒發商外資冀唐市字（2004）0115號《中華人民共和國外商投資企業批准證書》，於2004年11月10日取得唐山市工商行政管理局頒發的營業執照，公司經營期限20年，注冊資本人民幣5000.00萬元），公司始終嚴格生產過程 的每一道工序並涉足每一個細微環節，使臨三元食品更加尊貴.在「綠色、誠信、共贏」的公司方針指引下。取得了「企業、種植戶、客戶」的三贏奇效，欣得業界 人士和用戶的廣泛推崇和勝贊。
公司主要生產經營生產乳以及乳製品、鮮奶收購、良種奶牛養殖與銷售、良種奶牛生產的技術支持和服務、銷售本公司產品等等。
4、上海三元乳業有限公司
上海三元乳業有限公司於2009年12月登記注冊，是以營銷「三元」品牌全系列乳製品的公司，系北京三元食品股份有限公司的子公司。位於中國經濟發展龍頭的上海，營銷主要范圍覆蓋山東省及華東地區。
5、柳州三元天愛乳業有限公司
柳州三元天愛乳業有限公司：前身是柳州市奶業有限責任公司，2004年 經企業改制，由北京三元食品股份有限公司全資收購成立。
柳州三元天愛乳業有限公司擁有羊角山、鷓鴣江等老牌國營奶場，擁有2000畝 優質草地和1500頭奶牛，集50年奶牛養 殖經驗和20年乳品加工技術於一身，是柳州市奶業的龍頭企業，其生產的「三元」牌、天愛」牌鮮牛 奶、酸牛奶質量上乘，深受消費者歡迎。
經營范圍：消毒牛奶、含乳飲料、植物蛋白飲料、酸牛奶生產銷售；飼草、飼料、水產品、畜產品銷售；自有門面租賃；奶牛飼養與銷售。
6、北京八達嶺乳業有限公司
2002年11月14日，北京三元食品股份有限公司與與延慶畜牧服務中心簽訂合資合作協議，雙方以凈資產出資組建北京八達嶺乳業有限公司。公司注冊資金960.7萬元，北京三元出資672.49萬元占總股比的70%。該公司地處北京市延慶縣，佔地22畝，主要產品為奶粉。
7、北京百鑫經貿有限公司
原名為北京百鑫經貿公司，是北京市德瑞實業公司所屬的全民所有制企業，於2003年8月15日經主管單位北京三元集團有限責任公司京三元集團發[2003]255號文批准，改制為有限公司，更名為現名。公司經營期限20年，注冊資本2,403.43萬元。
公司經營范圍及主營業務主要包括商貿信息咨詢（中介除外）。
8、新鄉市三元食品有限公司
暫無
9、天津三元乳業有限公司
是由三元食品股份有限公司和天津海翔集團有限公司共同投資組建的有限責任公司。公司於2001年7月6日正式注冊成立，經營期限15年，注冊資本902萬元。公司住所：靜海縣雙塘鎮東雙塘村。公司經營范圍：乳業品製造。主營業務：乳業品製造。 1、北京三元德宏房地產開發有限公司
暫無 1、北京麥當勞食品有限公司
注冊資本2080萬美元，北京三元食品股份有限公司擁有其總股份的50%。北京麥當勞食品有限公司從事中西餐飲服務及銷售餐廳食品和冷熱飲料等，北京三元食品股份有限公司做為主要供應商為其提供乳酪等乳製品。 1、山東三元乳業有限公司
山東三元乳業有限公司隸屬首都農業發展集團，坐落於濰坊市坊子區，佔地面積240畝，總建築面積70000平方米。公司持有固定資產9600萬，注冊資金8000萬人民幣，主要負責乳製品（液體乳、飲料）的生產。預計日產銷量達300噸以上。
公司秉承質量第一的經營理念，堅信奶源是生產第一車間，嚴把原料奶質量關。
公司從德國、瑞典、英國、丹麥引進具有世界領先水平的檢驗設備和生產線，嚴格對原料、半成品及成品進行包括酸度、三聚氰胺、拮抗劑、抗生素、乳房炎、大腸菌群等理化和微生物指標的檢測。特別是引進高效液相、SNAP抗生素快速檢測儀等先進設備和方法對三聚氰胺、拮抗劑和抗生素等進行嚴格檢測，嚴防不安全原料奶進廠生產。
公司共有19條生產線，以生產百利包、利樂枕、利樂磚包裝形式的超高溫滅菌奶及含乳飲料系列產品為主，包括純牛奶系列、麥香系列、哈酸乳系列、大紅棗系列等，另外，公司還生產愛克林、大果粒、百利包、八連杯等酸奶產品。
山東三元的全體員工會團結奮進，以提高國民體制為己任，以不斷滿足消費者的需求為己任，真誠的服務奉獻社會。
2、唐山市三元食品有限公司
唐山市三元食品有限公司注冊資本103,425,000元人民幣，經營范圍為乳及乳製品製造和蛋白飲料製造。
3、江蘇三元雙寶乳業有限公司
暫無 1、北京聖德順飲品有限公司
北京聖德順飲品有限公司成立於2009年10月，注冊資金200萬元人民幣。主營業務為生產銷售植物性蛋白飲品。2009年12月，北京聖德順飲品有限公司與北京三元食品股份有限公司簽訂合作協議，按照合同規定，北京聖德順飲品有限公司可依法使用三元品牌，生產和銷售「三元」牌植物性蛋白飲品。
2、宏圖世紀（北京）食品有限公司
宏圖世紀（北京）食品有限公司成立於2009年11月，注冊資金100萬元人民幣。主營業務為生產銷售預包裝食品和散裝食品。2009年12月，宏圖世紀（北京）食品有限公司與北京三元食品股份有限公司簽訂合作協議，按照合同規定，宏圖世紀（北京）食品有限公司可依法使用三元品牌，生產和銷售「三元」牌八寶粥。
